DNA修复与新型靶向性癌症相关研究，PCR Clean™助力分子生物学

PCR Clean™分子实验是中常备的实验试剂，可有效地降解大多数表面上（轻质金属或有色金属除外）的扩增子，质粒或基因组DNA和RNA。该产品还能有效地去除DNA酶和RNA酶。

同源重组(HR)缺陷与DNA重排和细胞遗传畸变有关。矛盾的是，与hr缺陷型癌症相关的DNA重排类型对染色体结构的影响微乎其微。

近日，为了解决这一明显的矛盾，研究人员结合了46例BRCA1-或brca2突变型乳腺癌的数千个具有深连锁阅读WGS的肿瘤的短读全基因组测序(WGS)图谱的基因组图谱分析。

相关研究发表在《Nature》上，文章标题为：“Long-molecule scars of backup DNA repair in BRCA1- and BRCA2-deficient cancers"。

这些数据揭示了一类富含hr缺陷的重排，称为互易对。链读WGS显示，具有相同重排取向的互反对产生了两种不同的染色体结果之一，只能通过长分子数据来区分。一个(顺式)结果对应于一个小片段的复制和粘贴到一个遥远的位点，第二个(反式)结果是一个准平衡的易位或多兆碱基反转，在每个节点上都有大量(10 kb)的重复。我们提出了一个独立于hr的复制-重启修复机制来解释互惠对结果的全部范围。链接阅读WGS还发现单链退火是人类癌症中BRCA2缺乏特异性的修复途径。将这些特征整合到分类器中可以提高BRCA1-和brca2缺陷基因组之间的区分。

总之，该研究的数据揭示了在hr缺陷细胞中，BRCA1或BRCA2缺乏症的重排类型是细胞遗传畸变的来源。