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RNA测序又有新发现,PCR Clean助力科研

更新时间:2024-01-01  |  点击率:233

CRISPR是一种常用的基因编辑技术,CRISPR/Cas 系统被开发成一种高效的基因编辑工具。在自然界中,CRISPR/Cas系统拥有多种类别,其中 CRISPR/Cas9 系统是研究最深入,应用相对成熟的一种类别。CRISPR系统在实验过程中,需要对实验环境进行核酸污染控制。德国MB公司生产的PCR-Clean,高效清除实验环境或实验仪器上的DNARNA,和各种核酸酶污染,高效清除核酸相关污染,为分子实验保驾护航。

 

转录终止子,是决定信号RNA聚合酶(RNAPs)在何处停止,并与DNA解离关键点。然而,由于终止是随机的,可能会产生两种不同形式的转录本:一种在终止子处终止,另一种继续读取。能够控制这些转录本异构体的丰度将为生物工程师提供在转录水平上调控多基因构建的机制。

 

近日,科研人员通过重新利用终止子作为转录阀",调节RNAP读取的比例,探索了这一可能性。

 

相关研究发表在《nature communications》上,文章标题为:“Massively parallel characterization of engineered transcript isoforms using direct RNA sequencing"

 

通过使用混合DNA组装,科研人员迭代构建了1780T7 RNAP的转录阀,并展示了如何使用基于纳米孔的直接RNA测序(dRNA-seq)来在体外同时以核苷酸分辨率表征整个阀门库,并揭示调控和隔离终止的遗传设计原则。

 

最后,科研人员为CRISPR引导RNA的多路调控工程设计了阀门。这项工作为控制转录提供了新的途径,展示了长读取测序在探索复杂的序列-功能景观方面的好处。