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单细胞基因组学和调控网络取得新进展,支原体祛除喷雾助力科研

更新时间:2024-06-02  |  点击率:74

单细胞基因组学是一个精密的科研学科,每一个单独的细胞都弥足珍贵,包含着多样的遗传信息,是打开生命科学一把钥匙。在进行单细胞基因组学的实验室中,确保实验环境的纯净、避免细胞污染十分重要。德国MB公司生产的Mycoplasma Off,高效清除实验环境中的支原体、细菌等微生物污染

 

单细胞基因组学提供了一种强大的方法来了解变异如何影响基因表达,特别是在人类大脑中众多细胞类型中。此外,它可能会改善我们对大脑相关特征的调节机制的理解。然而,需要具有广泛脑表型的群体规模队列来推断变体之间的关键关联,并在单细胞规模上开发调节模型。

 

近日,科研人员为了解决这个问题,对受实验者进行了许多单细胞实验[单核RNA测序(snRNA-seq)snATAC-seq (ATAC,转座酶可及染色质测定)snMultiome +基因分型]和前额叶皮层样本的计算分析。

 

相关研究成果发表在《Science》上,文章标题为:“Single-cell genomics and regulatory networks for 388 human brains"。科研人员使用单核RNA测序 (snRNA-seq)、单核ATAC-seq测序及单核Multiome测序,并结合基因分型和计算分析,对含超过280万个单细胞核在内的388份人脑前额叶皮层样本进行了深度测序,并结合深度学习模型、eQTL (表达数量性状位点),构建了细胞类型特异性的基因调控和细胞间通讯网络,揭示了不同细胞类型在老龄化和神经精神疾病中的特定改变。

 

该项研究的人类大脑的人口规模单细胞资源,可以帮助促进神经精神疾病的精确医学方法,特别是通过优先考虑与细胞类型相关的后续基因和药物靶点。