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临床检测中ctDNA的意义,德国MB核酸污染祛除助力科研

更新时间:2023-08-03  |  点击率:365

随着核酸检测技术的发展,疾病检测技术也得以发展。核酸实验中即使只有一个污染的DNA分子被检测到,也会使整个PCR检测过程出现误差。为确保PCR试验数据准确,预防DNARNA交叉污染,PCR实验室大多会常备DNA/RNA污染清除剂。PCR Clean可有效地降解大多数表面上(轻质金属或有色金属除外)的扩增子,质粒或基因组DNARNA。该产品还能有效地去除DNA酶和RNA酶。

 

在过去的20年里,癌症存活率一直在不断提高,这在很大程度上归功于更有效的治疗和改进的患者管理策略。细化识别患者谁可能受益于辅助治疗后明确的管理是优化患者护理的关键。由于适当的干预可以改善预后,明智地使用额外的治疗可以使复发风险低的患者免受不良治疗效果和不必要的费用。

 

目前的疾病管理模式以肿瘤特异性、分期为基础的建议为中心,主要依靠病理和影像学结果来优化患者的治疗计划。虽然影像学是监测疾病进展或复发以及衡量治疗反应的标准方法,但放射学结果有时难以正确解释,导致假阳性和阴性的高发生率。基于血液的代谢肿瘤标志物(如癌胚抗原(CEA)、癌抗原(CA)-125CA19-9和乳酸脱氢酶(LDH))是评估疾病状态的一种非侵入性方法。然而,许多这些已建立的生物标志物被认为是不可靠的,因为它们可能由于与癌症无关的疾病而升高,导致低灵敏度和特异性。

 

ctDNA已经成为一种非侵入性的、基于血液的生物标志物,广泛反映了肿瘤组织中发现的体细胞变异。已经开发了几种测量ctDNA的方法,例如基于小组的测定,下一代测序和液滴数字聚合酶链反应,并在其他地方进行了深入讨论。除了每种肿瘤类型固有的生物学差异之外,每种检测的潜在ctDNA检测方法和分析验证措施(如敏感性和特异性)的差异也会影响对结果的后续解释。无论采用何种检测方法,在临床解释ctDNA结果时,也应考虑通过变异等位基因分数(作为百分比)或肿瘤分数(作为每毫升肿瘤分子的平均数量)来定量测量循环肿瘤负荷。ctDNA有多种应用,包括早期癌症检测、用于治疗选择的综合基因组分析、分子残留病(MRD)检测、复发监测和治疗反应监测。这些临床应用的适当测定可能会有所不同,这取决于在特定的临床场景中必须评估什么。

 

临床研究已经证实ctDNA检测及其浓度与肿瘤负荷、治疗反应和预后之间存在关联。使用不同分析技术的大量研究表明,ctDNA是一种敏感和特异性的MRD检测生物标志物。它可能比放射成像和其他标准护理(SOC)方法早几个月,但最好与标准监测诊断结合使用。然而,目前对ctDNA临床应用的了解仅限于主要是观察性或轶事性质的研究,并且仅限于特定适应症。有必要检查基于ctdnaMRD检测在跨适应症的介入性试验中的临床应用。目前这类临床试验的研究结果已经在之前的文献中进行了回顾。最后,目前只有少数基于ctdnaMRD检测方法可供临床医生商业化使用,每种方法都具有不同程度的预测和预后价值。因此,尽管ctDNA在癌症患者中的应用的现有数据很有希望,但至关重要的是,订购提供者了解这种新型生物标志物的含义、优势和局限性,以便将结果最佳地应用于临床实践。

 

研究人员对ctDNA进行优化,用于实体肿瘤MRD检测。研究人员还强调了ctDNA如何帮助指导癌症患者在其疾病过程中的临床管理。

 

相关研究发表在《Nature》上,文章标题为:“Practical recommendations for using ctDNA in clinical decision making"。

 

ctDNA检测在血液学恶性肿瘤中的应用和效用先前已经讨论过。早期癌症检测的筛查方法也会检查游离DNA (cfDNA),尽管也会分析其他特征(例如甲基化)。初步数据表明这种筛检的临床效用,但它们不是用于监测疾病进展的,因此不包括在本讨论中。本篇研究中,研究人员首先讨论在手术或最终治疗之前和之后ctDNA结果的解释。然后研究人员讨论了当ctDNA检测用于MRD时的技术考虑。科研人员对完成SOC治疗后ctdna阳性和阴性患者的处理提出建议。最后,本篇文章讨论了ctDNA检测在新辅助治疗中治疗反应监测的应用,特别是在免疫治疗的背景下。在所有情况下,评估ctDNA的结果都应该在对患者进行更大范围的综合评估的背景下进行,从而完善标准的临床分期和风险分层。